摘要
设计满足自然语言功能需求的蛋白质是蛋白质工程的核心目标。针对直接微调大语言模型(LLM)存在数据依赖高且“计划 - 执行”差距大的问题,本文提出了 ProtoCycle。这是一个代理框架,将 LLM 规划器与轻量级工具环境耦合,模拟人类迭代工作流程。该框架利用 LLM 对工具反馈进行反思以修正计划,并通过监督轨迹和在线强化学习进行训练。实验表明,ProtoCycle 在保持竞争力的可折叠性的同时实现了强大的语言对齐,且反思机制显著提升了序列质量。
AI 推荐理由
论文核心提出基于 LLM 的规划器,通过多轮反馈和反思机制迭代修正蛋白质设计计划。
研究机构
上海交通大学,数学科学学院
中国科学技术大学,科技部
中国科学院
论文信息